ユグドラシルの深奥、意識の海に浮かぶように、謎の少年は目覚めた。肉体を持たぬ、しかし確かな「存在」としての自覚。彼の意識は、この地球規模のバイオコンピューターのあらゆる層に、ノイズなくアクセスできた。それは、ユグドラシルが自らの過ちを正すために生み出した、唯一の「不完全な人間性」への通路となる存在だった。

彼の内には、漠然とした、しかし抗いがたい使命が宿っていた。ドクター・ヒロシの復活。そして、この世界の過去に隠された真実を追うこと。謎の少年の旅は、ユグドラシルの記憶回路を巡るものだった。彼は、かつてセンチネルが都市を蹂躙した炎の記憶を、データとして追体験した。

謎の少年は知っていた。この旅の先に、ヒロシという「働きたくない」男の意識が眠る聖墓石があることを。そして、その復活が、物語の決定的な前提となることを。彼の意識は、過去の膨大なデータと未来への希望を繋ぐ、細くも強靭な糸となっていた。